پژوهش علم علف هاي هرز

تأليف: محمد هیئت
 دانشجوی دکترای زیست شناسی مولکولی دانشگاه علوم پزشکی بقیه ا... (عج)
دکتر رضا رنجبر
دانشیار مرکز تحقیقات بیولوژی مولکولی, دانشگاه علوم پزشکی بقیه ا...(عج)  
فهرست:   9
فصل اول (حلال ها و محلول ها) 11
مقدمه  12
حلال‌ها 13
اثرعوامل فیزیکی مختلف در میزان حلالیت   13
طبقه بندی حلال‌ها 14
خواص فیزیکی حلال‌ها 17
نقطه جوش   17
چگالی  17
محلول‌ها 17
کلوئیدها 18
انواع محلول‌ها از لحاظ رقت   19
الکترولیت ها 20
اسید و باز 21
خواص عمومی اسیدها و بازها 21
فصل دوم (خواص کولیگاتیو محلول‌ ها) 23
مقدمه  24
خواص کولیگاتیو  24
تغییر فشار بخار مایع  25
بالا رفتن نقطه جوش   27
کاهش نقطه انجماد  28
افزایش فشار اسمزی   30
محلول‌های ایزوتونیک، هیپرتونیک و هیپوتونیک   32
فصل سوم (مفاهیم غلظت و تیتراسیون) 33
مقدمه  34
نمادهای کمی غلظت   34
1-غلظت جرمی (Mass concentration): 34
2-غلظت حجمی (Volume concentration): 35
3-غلظت مولی (Molar concentration) 35
4-عدد غلظت (Number concentration) 35
کمیت‌های مرتبط با نمادهای کمی غلظت   36
1-نرمالیته (Normality) 36
2-مولالیته (Molality) 37
3-کسر مولی(Mole fraction) 37
4-نسبت مولی (Mole ratio) 37
5-کسر جرمی (Mass fraction) 37
6-نسبت جرمی(Mass ratio) 38
7-قسمت درمیلیون (ppm)، قسمت درمیلیارد (ppb) و قسمت درتریلیون (ppt) 38
واحد های قرار دادی   39
1-واحد بین المللی (InternationalUnit) 39
2-واحد آنزیمي  40
3-فعالیت ویژه آنزیمی (EnzymeSpecificactivity) 40
تیتراسیون  41
انواع تیتراسیون  41
1-حجم سنجی  41
2- تیتراسیون وزن سنجی  42
تیتراسیون اسیدهای آمینه  45
ثابت تفکیک در اسیدها و بازهای ضعیف   46
فصل چهارم (بافرها و pH) 55
مقدمه  56
بافر  56
انواع بافرها 57
بافرهای ساده 57
بافرهای مرکب   57
ظرفیت بافری   60
اهمیت محلول‌های بافری   61
ترکیب بافری با محدوده وسیع  61
pH   62
اندازه‌گیری  pH   63
محاسبات pH   63
اسیدها و بازهای قوی   64
اسید و بازهای ضعیف   64
روش عمومی محاسبه pH   65
نمک‌ها 66
فصل پنجم (پروتکل ساخت بافرهای مهم در آزمایشگاه مولکولی) 69
مقدمه  70
1- بافرهاو محلول‌های عمومی آزمایشگاه‌های زیست شناسی مولکولی  71
بافر PBS  71
بافر TBE  71
EDTA با غلظت 5/0 مولار با pH معادل 8  71
بافر سدیم استات NaOAc  72
محلول اتانول/استات   72
بافر TE  72
بافر فسفات سدیم (PB) 1/0 مولار با pH 4/7  72
بافر TNT  72
BSA با غلظت 1 میلی گرم در میلی‌لیتر  73
بافر STB 1X   73
بافر TM   73
بافر TTE  73
2-بافر ها و محلول های مورد استفاده در ژل اکتروفورز آگارز 73
بافر TAE  73
محلول رنگ اتيديوم برومايد  74
محلول رنگ SYBR سبز  74
لودينگ بافر ژل آگارز 74
لودينگ بافر GelRed  74
3-بافرهای مورد نیاز برایSDS-PAGE  75
SDS 10 درصد  75
محلول A   75
محلول B   75
محلول C   75
آمونيوم پرسولفات 10درصد  75
بافر تانک الكتروفورز 75
سمپل بافر  76
بافر نمونه‌ی Laemmli 76
محلول رنگ کوماسی بلو  76
محلول رنگ کماسی بلو کلوئیدی   76
محلول رنگبر کوماسی بلو  77
4-بافرهای تخليص پلاسميد و ژنوم  77
فنول اشباع  77
بافرSET  77
محلول لیزوزیم  77
محلول جت/لیزوزیم  78
بافر ليز كننده 78
پروتئيناز K   78
استات پتاسيم  78
RNAase A بدون DNase  78
محلول فریز کردن پلاسمید shotgun، cDNA، در پلیت های میکروتیتر  78
بافر X10دناتوراسیون  79
تهیه محلول CTAB/NaCl 79
بافر ريپا 79
5-بافر ليز سلولها 80
بافر مخلوط کننده 80
بافر متعادل کننده 80
6-بافرهای ELISA   80
بافر کوتینگ آنتی بادی در فرایند الیزا ( بافر کربنات/بیکربنات 5/0مولاربا pH 6/9) 80
بافر کوتینگ آنتی ژن در فرایند الیزا 81
بافر شستشو در الیزا 81
بلاکینگ بافر پس از کوتینگ آنتی ژن یا آنتی بادی   81
بافر رقیق سازی آنتی بادی   81
محلول خاتمه دهنده فرایند الیزا 81
7-بافر ها و محلول های وسترن بلاتینگ   81
بافر تانک وسترن بلات   81
محلول رقیق سازی آنتی بادی برای وسترن بلاتینگ   82
محلول شستشو برای وسترن بلاتینگ   82
محلول بلاکینگ برای وسترن بلاتینگ   82
8-بافر PCR   82
dNTP’s 10 میلی مولار 82
بافر Oliver 83
محلول پايانی PCR   83
9-بافر لیگیشن X10  83
10-بافر کیناز X10  84
11-بافر های هیستون  84
محلول ليز هيستونها 84
محلول شستشوی هيستونها 84
محلول استخراج هيستونها 84
بازدارندههای آنزيم پروتئاز 85
بازدارندههای فسفاتاز 85
12-بافرها و محلول‌های نورترن و ساترن بلاتینگ   85
بافر SSPE 20X (Saline Sodium Phosphate EDTA) 85
محلول دان هاردت (X100) 85
محلول پیش هیبریداسیون نورترن بلات   86
محلول هیبریداسیون نورترن  بلاتینگ   86
محلول A شستشوی نورترن  بلاتینگ   86
محلول B شستشوی نورترن  بلاتینگ   86
محلول C شستشوی نورترن  بلاتینگ   86
محلول SSC (pH 7) 86
محلول پایه ساترن بلاتینگ (به صورت تازه تهیه و استفاده گردد) 86
محلول X1دناتوره کردن ساترن بلاتینگ   87
محلول X1خنثی سازی ساترن بلاتینگ   87
محلول پیش هیبریداسیون ساترن بلاتینگX1  87
محلولX 1 هیبریدیزاسیون ساترن بلات   87
بافر X1 پروب برای ساترن بلات   87
محلولX1 مخلوط پروب ساترن بلات   87
محلول شستشوی X6 ساترن بلاتینگ (600 میلی‌لیتر) 88
13-بافر ها و محلول های زایموگرم  88
محلول ژل استکینگ زایمو گرم  88
محلول ژل جداکننده زایموگرم  88
سمپل بافر زایموگرم  88
بافر شستشوی زایمو گرم  88
محلول رنگ آمیزی زایموگرم  88
14-بافر های ستون تخلیص پروتئین در شرایط دناتوره 88
بافرB   88
بافر C   89
بافرD   89
بافر E  89
15-بافر تخلیص پروتئین های پریپلاسمیک   89
16-بافر های تخلیص پروتئین های غشایی  89
بافر 1 جهت تخلیص غشا 89
بافر 2 جهت جداسازیِ غشای داخلی و خارجی  89
17-بافر های تخلیص انکلوژن بادی   90
بافر شماره 1  90
بافر شماره 2  90
18-بافر حل کننده انکلوژن بادی   90
بافر A   90
بافر B   90
19-بافر آماده سازی کیسه دیالیز  90
محلول گوانیدین هیدروکلراید  91
20-بافرهای دیالیز  جهت فرایند ریفولدینگ   91
بافر پایه دیالیز  91
21-بافر های Bst 91
بافر رقیق سازی Bst 91
بافر واکنش Bst 92
مخلوط امتداد نوکلئوتیدی Bst 92
مخلوط A خاتمه دهنده کوتاه  Bst 92
مخلوط C خاتمه دهنده کوتاه  Bst 92
مخلوط G خاتمه دهنده کوتاه  Bst 93
مخلوط T خاتمه دهنده کوتاه  Bst 93
مخلوط A خاتمه دهنده طولانی  Bst 93
مخلوط C خاتمه دهنده طولانی  Bst 94
مخلوط G خاتمه دهنده طولانی  Bst 94
مخلوط T خاتمه دهنده طولانی  Bst 94
واژه یاب    95
منابع   97